Vai variar com hardware e acho que você precisa de 2 placas de som separadas ou uma placa de som / mixer capaz de tal separação.
Você pode então configurar o pulseausio para enviar a saída para locais / cartões específicos com pavucontrol
, na aba de reprodução
Pode ser necessário instalar o pavucontrol, seja com o apt-get ou a partir do centro de software.
sudo apt-get install pavucontrol
Se por algum motivo, o pulseaudio não fizer isso, o jack irá, mas a configuração do jack pode ser avassaladora. Se você é novo no Jack, sugiro Cadence, com uma ferramenta gráfica fornecida como um binário