Até onde sei, você só pode instalar uma versão do IIS no Server 2012, que é o IIS 8.
Eu entendo que você gostaria de usar o IIS6, mas não deve haver nada que você possa fazer no IIS 6 que não seja possível no IIS 8, com uma pequena configuração. Normalmente, coisas como ativar o suporte de 32 bits para DLLs externas, alterar a identidade do pool de aplicativos, o Legacy SMTP, o suporte Legacy FTP, as configurações do ASP, etc. Também o IIS6 não é um ponto de vista de segurança excelente.
O IIS8 é fornecido com ferramentas de gerenciamento do IIS6 para configurar aplicativos legados que usam serviços como o SMTP.
Você pode usar as ferramentas do IIS 6 executando %windir%\system32\inetsrv\InetMgr6.exe de um CMD no núcleo do servidor ou em Ferramentas Administrativas - Gerenciador do IIS (Serviços de Informações da Internet) 6.0 na Experiência Desktop
Para instalar um IIS 8 completo, incluindo todos os recursos, você pode usar o comando abaixo.
Install-WindowsFeature -Name Web-Server -IncludeAllSubFeature
Se você conseguir atualizar sua pergunta, incluir a versão do servidor que está executando (Core, Desktop Exp) e o motivo pelo qual você precisa do IIS6, será mais fácil apontar você na direção certa