Você pode executar várias instâncias do mesmo script python (e o shell script também) - cada uma é executada como um processo separado, com sua própria memória, variáveis, etc.
Mas há uma ressalva para isso: se eles trabalham com os mesmos arquivos, você pode ter conflitos lá. Se eles tentarem enviar para o mesmo arquivo, você poderá sobrescrever outros, ou algo semelhante. Se todos eles estão tentando modificar um arquivo, as coisas podem ficar ainda mais confusas.