Você precisa primeiro remover a pasta redirecionada (esvaziá-la não é suficiente). mklink
não pode transmutar diretórios em junções; o nome deve estar disponível antes que possa criar a junção. Tente renomear a pasta Backup
para outra coisa, criando a junção com o primeiro comando e, em seguida, movendo os arquivos desejados de volta para a pasta agora redirecionada.