Você só precisa passar a variável NR.RefersTo
para uma variável de tipo string para poder usar a função Like
.
Esse código funciona para mim. Obviamente, edite $E$28
para se adequar.
Option Explicit
Sub deleteNamedRangesSpecific()
Dim NR As Name
Dim compare_string As String
For Each NR In ActiveWorkbook.Names
compare_string = NR.RefersTo
If compare_string Like "*" & "$E$28" & "*" Then NR.Delete
Next
End Sub