No GIMP 2.10, isso agora deve estar praticamente obsoleto - a interface aparece mesmo se o cache de fontes ainda estiver sendo construído, e somente se você quiser usar as ferramentas de texto na imagem, poderá encontrar uma mensagem apontando para fora.
Além disso, versões mais atuais da biblioteca fontconfig têm muito menos probabilidade de criar um cache corrompido de fontes, de modo que as reconstruções ocorrem com menos frequência.