Os arquivos infectados provavelmente não afetarão sua instalação do Linux. Os vírus que podem afetar sua instalação do Linux são muito raros!
O mais provável é que você tenha navegado para um site que foi comprometido e um arquivo com algum código de rastreamento suspeito tenha sido armazenado em cache. Esses tipos de arquivos geralmente estão segmentados para PCs com Windows vulneráveis.
Tente limpar o cache do Firefox e do Chrome e faça uma nova verificação. Eles devem ter sumido.
Se você estiver preocupado com a possibilidade de serem maliciosos, verifique a área de quarentena para obter o nome do vírus e pesquise na Internet qualquer informação sobre esse vírus.