Aparentemente, o que eu estava procurando é o FLAC sem compactação. Essa codificação pode ser feita com ferramentas como dBpoweramp Music Converter ou XRECODE3.
De aqui , obtive um comando linha para libFLAC para obter um resultado similar:
flac --disable-constant-subframes --disable-fixed-subframes --no-seektable -l 0 -b 4608 -V input.wav -o output.flac
Repositório excluído.