Falando em termos de lógica, poucos ou nenhum sistema operacional requer partições contíguas; você pode intercalá-los como quiser; no entanto ...
Em um disco rígido giratório tradicional, as buscas na cabeça levam tempo, e quanto maior a distância entre as partições, mais as buscas demoram. Assim, separar duas partições usadas pelo mesmo sistema operacional pode degradar o desempenho, uma vez que os tempos de busca da cabeça aumentarão em comparação a manter essas partições juntas. A extensão desse problema varia dependendo do hardware do disco, da natureza das partições e do tamanho da lacuna entre elas. Por exemplo, se você separar uma partição /boot do Linux de sua partição raiz principal ( / ), provavelmente verá pouca degradação no desempenho, porque a partição /boot raramente é acessada depois que o SO é inicializado; mas se você separar /home da raiz ( / ), provavelmente verá mais degradação.
Estou menos familiarizado com algumas das partições especializadas do Windows que estão aparecendo ultimamente, e há menos padronização nos usos de partições no mundo do Windows do que no Linux, por isso é difícil para mim comentar sobre o layout proposto. Em particular, o que há em suas partições C: e D: do Windows? Além disso, o que há nessas partições de ~ 500MB no início e no final do disco?
Você também deve ter em mente o fato de que as operações de redimensionamento e movimentação de partições levam tempo e não são isentas de riscos. Você pode querer aceitar alguma pequena degradação do desempenho no dia a dia, em vez de gastar tempo para mover suas partições e arriscar a perda de dados ao fazer isso. (OTOH, se você tem backups adequados, mover suas partições não deve arriscar a perda real de dados e, se você não tiver backups adequados, estará arriscando a perda de dados catastróficos todos os dias.)
Observe também que esses problemas de desempenho são irrelevantes para os SSDs, que armazenam dados em chips, em vez de em um meio com partes móveis em movimento. Em um SSD, o desempenho não é afetado pela distância entre as partições. Existem outros problemas de desempenho com SSDs, no entanto. Mais notavelmente, você deve ativar TRIM em seus sistemas operacionais. Várias páginas, como este , descreve outras coisas que você pode fazer para melhorar o desempenho do SSD.