COUNTIFS()
não parece gostar de misturar constantes de matriz e referências de célula como essa. Ele funciona bem se você codificar a data assim:
=SUM(COUNTIF(D1:D4,{">12/1/2015",""}))
Ou, se você não quiser codificar, use essa fórmula de matriz. Esta fórmula deve ser confirmada com ctrl + shift + enter.
=SUM(--(D1:D4>E1),--(D1:D4=""))
Observe que essas duas soluções, bem como apenas =COUNTIF(D:D,"")
, contarão todas as células em branco na coluna, portanto, você não poderá selecionar a coluna inteira (a menos que seus dados preencham a coluna inteira ).