Um arquivo em lote não funciona dessa maneira - cada linha é interpretada como um comando para execução. Quando você estiver chamando ipmish.exe , ele bloqueará o restante do lote até que o processo termine.
Para alcançar o que você deseja fazer, consulte a documentação de ipmish.exe e veja se há um método de script para ela (como você pode especificar -interactive , fico com a impressão pode haver uma interface de script). Como alternativa, você poderia procurar usar uma solução de software diferente para executá-la como um "lote", mas com a capacidade de enviar chaves para ela, como AutoIt ou semelhante.