TL; DR: A menos que você esteja procurando especificamente velocidades máximas de transferência em massa, você não precisa do link de 6 Gbps e a maioria dos SSDs não é tão rápida assim. Você ainda obterá um bom aumento de velocidade mesmo com links SATA de 3Gbps se for do HDD para o SSD.
O controlador SATA no mobo impacta definitivamente a velocidade máxima de suas portas SATA. Se você não consegue encontrar as especificações de velocidade ou versão SATA (SATA2 é 3Gbps, SATA3 é 6Gbps) para sua mobo e tem mais de alguns anos, há uma boa chance de não suportar 6Gbps.
Lembre-se, um grande número ( a maioria ?) dos SSDs de consumo também não pode aproveitar totalmente os 6Gbps (750MB / s). Eles tendem a superar os 550MB / s (4.4Gbps). Existem alguns SSDs de última geração que pressionam o limite de 6 Gbps, mas você ainda pode obter um armazenamento muito mais rápido usando um SSD mais barato e usando-o com o SATA2.
A maior parte da vantagem de velocidade de um SSD (para uso típico de PC, em oposição a qualquer coisa de dados em massa) é a busca instantânea, não a velocidade de E / S em massa. Até mesmo um HDD magnético pode atingir 200MB (1,6Gbps), o que quase certamente carrega dados mais rapidamente do que você pode processá-lo, mas provavelmente é pouco mais da metade do que suas portas SATA poderiam suportar. Isso é sequencial I / O, no entanto; jogar na busca, e a velocidade de um HDD cai drasticamente.
Assim, se você tiver um SSD, ainda terá um grande aumento na velocidade. 3Gbps é quase duas vezes mais rápido do que o HDD mencionado acima (e 6Gbps quase 3.75x), mas esse não é o fator importante. A principal vantagem de velocidade de um SSD é que, não importa onde os dados estão no disco ou mesmo o quão fragmentado ele fica, a velocidade não diminui com um SSD. Para um HDD com um tempo médio de busca de 10ms, o carregamento de arquivos de 100 bytes demora mais do que o carregamento de um único arquivo de 100 MB, mesmo que seja um milhão de vezes mais dados. Um SSD (mesmo em 3Gbps) carregaria os 100 MB mais rapidamente que o HDD, mas carregaria os cem minúsculos arquivos muito mais rápido.