Soa como um bug: especificamente, uma falha no gerenciador de janelas. Você pode verificar o arquivo .xsession-errors
em seu diretório pessoal para quaisquer mensagens de erro pertinentes.
Por outro lado, o gnome-session deve reiniciar o gerenciador de janelas caso ele falhe, e não sei por que isso não está acontecendo aqui.
Você usa os efeitos da área de trabalho? Talvez o compiz ainda esteja rodando, e foi o gtk-window-decorator que caiu?