O seguinte funciona com bash :
sed $'s/6\t$//' infile >outfile
O regex 6\t$ corresponde a um octal 016 e uma guia no final de uma linha. Se esta string for encontrada, ela será substituída por nada.
O formato da string $'...' requer bash . Eu testei o acima com GNU sed , mas supostamente deve funcionar com BSD sed também.
Outro método, que funciona com o GNU sed sem bash , é:
sed 's/\o016\t$//' infile >outfile