O "\" na página da Web vinculada não é realmente parte da linha de comando. No Linux, um "\" no final de uma linha é uma informação para o shell que a linha de comando envolve duas linhas e que o shell deve remover o "\" e anexar a próxima linha à linha atual.
Portanto, remova o "\" e apenas escreva
ffmpeg -i front_left.wav -i front_right.wav -i front_center.wav -i lfe.wav -i back_left.wav -i back_right.wav -filter_complex "[0:a][1:a][2:a][3:a][4:a][5:a]amerge=inputs=6[aout]" -map "[aout]" output.wav
e funcionará.