Eu tive o mesmo problema depois de reinstalar o Win7 64bit no meu SSD C Drive, embora a unidade C tenha se comportado bem. Tentar instalar programas, copiar ou excluir arquivos grandes de / para uma partição na minha unidade D existente (um disco rígido SATA) demorou uma eternidade (horas) ou desligou como você descreve. Esta partição tinha os restos de instalações antigas, como bckups de 'Meus documentos' junto com os programas que rodavam desde a última instalação do Windows (que se tornou muito instável). No modo de segurança, as transferências de e para esta partição para um disco rígido externo ocorreram em velocidade normal e o chkdsk não revelou erros. A única cura que consegui encontrar (como não-técnico) foi excluir a partição D, recriar e reformatar o formato. Agora tudo instala / exclui como deveria.