Isso é comum, e é porque o Icon com o quadro ao redor não tem uma camada RGB 256x256 que é usada no Vista + para ícones maiores que "Medium".
Aqui está um exemplo ...
Dois ícones, um com quadro (à direita), um sem (à esquerda):
Camadasnoíconecomframe(Laranja):
Camadas no ícone sem frame (Vermelho um):