Sim, isso deve ser possível. Aqui está um trecho do script de inicialização do dropbox do gentoo:
start() {
ebegin "Starting dropbox..."
for dbuser in ${DROPBOX_USERS}; do
start-stop-daemon -b -o -N ${NICENESS} -c $dbuser -S -v -e HOME="/home/$dbuser" -x /home/$dbuser/.dropbox-dist/dropboxd
done
eend $?
}
No seu caso, os comandos que você precisa executar seriam
HOME="/home/user/.dropbox/work" /home/user/.dropbox-dist/dropboxd
HOME="/home/user/.dropbox/personal" /home/user/.dropbox-dist/dropboxd
certifique-se de linkar a pasta ~ / .dropbox / work / Dropbox criada na primeira execução de cada processo para ~ / Dropbox / Work ou ~ / Dropbox / Personal ou alterá-lo usando o script descrito no dropboxwiki .