Não me permita ser portador de más notícias.
Parece que a sobreposição da barra de progresso é implementada pelo Firefox, então duvido que você possa desabilitar no Windows. Parece não haver nenhuma maneira de desativá-lo no Firefox atualmente.
No entanto, de acordo com uma resposta dada a esse mesmo problema, uma possível solução pode ser editar determinados arquivos na API de download do Firefox, o que faz com que o download seja concluído.
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