Você verificou a configuração "Avisar antes de arquivar"? Se estiver marcado, não será iniciado o arquivamento sem que você o diga.
A maneira rápida de verificar se as próprias configurações de arquivamento não estão com falha é acionar manualmente o processo de AutoArquivar. Se você manualmente acioná-lo e tudo arquiva corretamente, então você tem a configuração correta.