Não, você nunca deve modificar ou excluir os arquivos do sistema em /usr/bin . Alguns scripts podem depender de /usr/bin/svn .
Em vez disso, modifique seu caminho para colocar /usr/local/bin antes de /usr/bin . Coloque o seguinte no seu ~/.bash_profile :
export PATH=/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/usr/sbin:/sbin