Tente executar um comando como este:
exiftool -o . '-Filename<DateTimeOriginal' -d /path/to/target/%Y/%Y\ %m\ %d/%Y_%m_%d_-_%H_%M_%S.jpg -r /path/to/pictures
-o . copia os arquivos em vez de movê-los. -Filename<DateTimeOriginal altera o nome do arquivo com base na data EXIF. -d especifica um formato de data.