O problema mais comum com a pasta térmica é aplicar demais.
O objetivo da pasta é minimizar as "coisas" entre a CPU e o dissipador de calor. Este material pode ser ar ou pasta térmica.
Colheres como Artic Silver não devem ser mais do que uma pequena ervilha no centro, depois revestidas uniformemente. Outras almofadas são medidas para o seu soquete e devem ser à prova de erros.Outra possibilidade é que você tenha usado um bom álcool para limpar a CPU e o dissipador de calor antes de aplicar, caso contrário você não terá um bom contato entre a CPU e o HSF.