Para ser honesto, eu não estou ciente de nenhum utilitário para verificar erros de instalação, mas se você está experimentando algum comportamento estranho do sistema operacional, você pode tentar reinstalar o ubuntu-desktop metapackage, ele deve reinstalar tudo o que pode ser perdido / danificado durante a atualização.
Estou usando o Kubuntu e, às vezes, quando recebo problemas na atualização dos arquivos do ambiente KDE, a reinstalação de kubuntu-desktop (que, como você pode imaginar, equivale a ubuntu-desktop para o Kubuntu) resolve tudo.
De qualquer forma, de um ponto de vista mais geral, descobri que, ao fazer grandes atualizações de versão, é melhor usar um LiveCD, em vez de usar as opções de atualização integradas, ele causa muito menos problemas; se você tiver sua pasta / home em uma partição separada, você não perderá nenhum dado e terá simplesmente que reinstalar algum software.