Para janelas, você pode usar algo como SyncToy . É uma poderosa ferramenta de sincronização oferecida pela Microsoft.
SyncToy 2.1 is a free application that synchronizes files and folders
between locations. Typical uses include sharing files, such as photos,
with other computers and creating backup copies of files and folders.
Usando essa ferramenta, você pode definir diferentes tipos de relacionamentos -
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Sincronizar: Os arquivos novos e atualizados são copiados nos dois sentidos. Renominações e exclusões de ambos os lados são repetidas no outro.
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Eco: Os arquivos novos e atualizados são copiados da esquerda para a direita. Renominações e exclusões à esquerda são repetidas à direita.
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Contribuir: Os arquivos novos e atualizados são copiados da esquerda para a direita. As renomeações à esquerda são repetidas à direita. Nenhuma exclusão.