Dois testes que eu tentaria: tente instalar em um HD diferente para ver se há problemas (isso soa como um problema no disco rígido). Se isso não gerar mudanças, tente inicializar com um CD de boot como o Hiren's Boot e veja se os resultados são os mesmos.
Se ambos produzirem o mesmo resultado, eu desconectaria todo o hardware, exceto o teclado / mouse / monitor. Se o Windows inicializar, adicione cada um deles entre as reinicializações para encontrar o hardware que está causando problemas.