Você precisa adicionar "*" atrás dos caminhos excluídos. Como isso funciona, o algoritmo exclui o padrão, não o diretório.
Então o padrão / home / jlacroix / Music! = /home/jlacroix/Music/*
Dê um tiro, funciona para mim aqui.
Editar :
Isso ainda faz o backup do nome do diretório, no entanto. Então você realmente precisa que pareça assim:
--exclude=/home/[username]/Music/* --exclude=/home/[username]/Music \
Isso seria verdadeiro para o restante dos itens.