O problema é que o tema não foi carregado corretamente para aplicativos GTK + 3: um bug em xfce4-settings impediu. A execução de um aplicativo do shell (por exemplo, o lançamento de gtk3-demo ) deve exibir o problema.
Há um punhado de soluções alternativas que podem ser tentadas: se você atualizou xfce4-settings para pelo menos 4.10.1 e mudaram o tema após essa atualização o problema deveria ter sido resolvido por si só.