A correção automática de 0 não funciona muito para mim, pois corrige automaticamente um 0 em espaços. Mas também não consigo reproduzir a quebra de linha. O que você pode fazer com facilidade é fazer uma pesquisa e substituir pela formatação. Isso não mudará zeros para destacados imediatamente, mas você poderia simplesmente aplicá-lo com um pouco de frequência, então.
Mas para resolver sua segunda pergunta: Para editar uma grade de zeros e uns, eu provavelmente usaria uma imagem bitmap e usaria Paint, Paint.NET ou o que fosse apropriado. Em seguida, um script simples poderia converter a imagem no arquivo de texto necessário de zeros e uns.