Você precisa adicionar espaços ao redor do seu > & gt ;. Seu shell acha que você tem um nome de arquivo muito longo /disk1/hadoop/gunzip_tmp/in/part-00006.gz>>/disk1/hadoop/gunzip_tmp/outfile.000
e não está vendo o > > ou o segundo nome de arquivo.
você deve escrever:
gunzip -c /disk1/hadoop/gunzip_tmp/in/part-00006.gz >> /disk1/hadoop/gunzip_tmp/outfile.000
Observe os espaços em torno de >>