Acredito que sua melhor aposta seria usar o agendador do uTorrent ou, conforme a sugestão do ta.speot.is, tentar usar QoS.
Se você está procurando um software de QoS em vez de usar seu roteador, pode dar uma olhada no NetBalancer . Com ele, você pode definir a prioridade do uTorrent para ser menor que a do Firefox (por exemplo).