Parece que um problema de configuração do terminal está atrapalhando a exibição da tela. Tente certificar-se de que seu putty está emulando o VT100. Então, depois de conectar o servidor, no shell Bash, digite
export TERM = vt100
execute o seu emacs. O Windows e o Putty são ambos insatisfeitos com isso; você pode ter que mexer um pouco.