Sim, você pode usar o dpkg-repack para realizar isso.
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Instale o dpkg-repack e fakeroot ( para evitar ser root para reembalar). Ou do terminal:
sudo apt-get install dpkg-repack fakeroot
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Reembale o pacote instalado
fakeroot -u dpkg-repack <package name>
E você encontrará o pacote no diretório atual.
Observe que quaisquer alterações no sistema no pacote depois de ele ser instalado serão refletidas na versão reembalada!