Eu finalmente descobri o que estava acontecendo. Não era nem root kit nem vírus. Em vez disso, é um controlador RAID com falha na minha placa-mãe, que estava causando arquivos em toda a unidade para se tornar corrompido, causando mais e mais aplicativos e serviços com falha ao longo do tempo. E, no entanto, o diagnóstico após o diagnóstico, incluindo o diagnóstico integrado do controlador RAID, não relatou problemas. Então, juntando as peças e construindo um novo sistema a partir do zero.
Eu descobri depois que explodi o sistema e reinstalei o Win7 e alguns aplicativos, como o Office, e comecei a monitorar de perto. Nas duas semanas seguintes, um arquivo após o outro se tornou corrompido e a inicialização estava demorando mais e mais enquanto ele continuava executando o reparo de inicialização e o checkdisk para reparar a corrupção.