Parece um problema de driver - ou talvez o microfone que você está usando esteja na "porta errada".
Tente executar alsamixer
em um terminal enquanto a caixa de diálogo de preferências de entrada estiver aberta. É possível que alguma configuração seja silenciada.
O alsamixer tem alguns controles de tecla "ímpares", então você pode querer revisar um manual primeiro.
Além disso, você terá que experimentar um programa que possa escolher sua fonte de entrada. O OSS pode funcionar se o PulseAudio ou o ALSA não funcionarem.