Você pode querer dar uma chance para kdenlive , que inclui vários plug-ins de keyframable como os que você pode precisa para fazer esse trabalho.
Me vem à mente o plugin de faixa "MaskOMate" para "cortar" a parte da imagem que você deseja colocar sobrepondo o vídeo. É claro que será útil se você preparar as imagens primeiro para se adequar ao tamanho do projeto, com transparência, então simplesmente use a transição da faixa "Composta" para colocar as imagens sobre o vídeo.
Os plug-ins "MaskOMate" e "Composite" são fundamentais, para que você possa escolher onde colocar seus elementos de vídeo em um determinado momento da reprodução do vídeo.
Consulte o site oficial do kdenlive e a página de efeitos do criativo para obter mais informações.
Na próxima tela, estou usando uma imagem de transparência pré-criada com uma garota espantada para colocá-la no vídeo de fundo em que um homem está aparecendo em uma parede de tela verde. Claro, eu também usei o Plugin "Pan and Zoom" para aumentar a imagem. Lembre-se: quanto melhor forem as suas fontes, melhores resultados você terá.
O que você deseja alcançar é complicado e um trabalho árduo, mas com paciência e criatividade você pode criar um vídeo incrível.
Boa sorte!