Eu acredito que a maneira mais fácil é apenas manter a instalação do Windows. A maioria dos instaladores do Linux redimensionará a partição existente do Windows para liberar espaço para o Linux.
Dessa forma, você pode inicializar duplamente ou executar o Windows em uma VM (a maioria das VMs permite que você execute o SO a partir de uma partição real).
Também existem ferramentas para criar uma imagem de VM a partir de uma partição, mas isso será mais trabalhoso.
Aqui está um HOWTO: