Não há como restaurar um sistema operacional em funcionamento. O GetDataBack do Runtime tem um modo para tentar recuperar arquivos de danos sofridos, como a reinstalação do sistema operacional, mas dependendo do tamanho da unidade e da quantidade de dados gravados, você terá um sucesso variável. O software é somente Windows, então eu retiraria o disco e o colocaria em uma máquina Windows.
Para ser honesto, a chance de muito sobreviver a duas reinstalações não é tão boa, mas você pode recuperar alguns arquivos. O entalhe de arquivos deve lhe dar alguns resultados, mas o problema é que ele vai pegar as coisas do Linux, bem como os arquivos antigos do Windows. Se você precisar de algo de verdade, leve isso para um profissional.