Qual é o comando que você está usando para executar o hunspell?
hunspell −d de_DE -i UTF-8 filename
Se não tiver sorte,
SET UTF-8
... deve entrar no seu arquivo de afixo. No seu caso, seu arquivo de afixo é provavelmente de_DE.aff.
O padrão, se nenhum for especificado, é
/usr/share/myspell/default.aff
Espero que isso ajude!