Parece que você especificou uma cor (mesmo sem cor) para a formatação condicional quando adicionou as bolinhas.
Se você abrir o formato condicional na guia Preenchimento e clicar no botão Limpar no canto inferior direito, selecione novamente o padrão de bolinhas para aplicar os pontos sem alterar a cor subjacente. Isto é, obviamente, supondo que você não tenha outros formatos condicionais aplicando cores a essas células.