Eu segui suas instruções:)
Quer dizer, criei uma pasta chamada Código/ e depois executei o mesmo comando (errado).
O que aconteceu foi que a pasta Código/ foi renomeada para ..-Code/ . O nome da pasta começa com um ponto ( . ), por isso agora é uma pasta oculta.
Agora, se você executar ls -a no seu terminal, a pasta ..-Code/ deve aparecer (assim como todos os arquivos ocultos no diretório).
Você também pode ver arquivos ocultos usando o Nautilus (gerenciador de arquivos do Ubuntu) pressionando Ctrl+H .
EDIT : para recuperar ('un-hide') a pasta, você só precisa executar mv ..-Code ./Code e você terá a pasta nomeada como você queria.