Use um script para desligar seu computador, você tem algumas opções:
shutdown.exe /s /f /t 0 /d p:2:4
isso desliga o PC da maneira antiga sem inicialização rápida, que agora é o padrão ao usar a GUI. Isso faz com que a inicialização seja mais lenta.
Mantendo a inicialização rápida, você pode interromper seus serviços primeiro e depois desligar o Windows 10:
net stop webService
net stop databaseService
shutdown.exe /s /f /t 0 /hybrid /d p:2:4
observe a opção /hybrid
para o comando shutdown, isto é para usar inicialização rápida.