Para referenciar uma tabela na fórmula de formatação condicional, você precisará usar INDIRECT("<Table_Name>")
.
Sua fórmula será assim: =VLOOKUP($A2,INDIRECT("Table3"),2,FALSE)>=B$1
Eu não sei porque, mas funciona.
Referência: Como usar um nome de tabela em listas de validação de dados e fórmulas de formatação condicional
(BTW: Por que você não usa apenas a formatação condicional da "Barra de dados" na sua tabela? Seria muito mais fácil).