Eu acredito que você tenha algo errado aqui, porque o Sysprep não modifica outras instalações. Em vez disso, pode ter mudado o BCD GUID de ambas as entradas de inicialização para a segunda instalação / partição generalizada, como a que vemos em este fio (exceto pelo fato de que ele dual booted windows 7 e 8.1, em vez de duas janelas 7s). Tente executar um reparo de inicialização para corrigir os bootloaders para você. Se não funcionou no entanto, você pode adicioná-los usando o utilitário de linha de comando "bcdedit". Já que ambas as partições estão lá e ainda intactas, você só precisa criar ou atualizar a entrada de inicialização da primeira instalação. Caso precise que eu esclareça alguma coisa, por favor, deixe um comentário e atualizarei minha resposta com mais detalhes.