Qual é a marca do HDD "antigo"? É um disco eficiente em termos energéticos, como o WD Green? Isso pode ter algo a ver com isso.
Mais uma coisa para olhar, eu postei uma pergunta ontem sobre o PUIS - Power Up In Standby - novamente se a sua unidade tiver isso ou algo similar, e os jumpers estiverem configurados, pode ser invocado? Um fim de semana, talvez?
Eu acredito que muitos HDDs de nível Enterprise / Server desligarão automaticamente - eu também estava procurando alguns WD Reds por esse motivo.
Não é uma resposta completa, mas esperamos que o leve na direção certa?
Pensei um pouco: você quer dizer girar ou as cabeças só estão estacionadas? Existe isto para as unidades WD Green: para controlar o problema de estacionamento. link