Não há razão para que a maioria das operações tenha que mudar se você fizer isso. Você ainda pode usar o cliente vSphere para poder realizar todas as operações nas VMs, como reinicialização, desligamento, reversão para captura instantânea ou outras. Você também poderá adicioná-los ao VMWare Workstation se tiver a versão mais recente. Tudo o que você precisa fazer é adicionar o host ESX como um servidor remoto.
O fato de cada VM ter seu próprio nome de rede só deve tornar as coisas mais simples. A única coisa em que você terá que pensar é que seus usuários precisarão ser autorizados para essas VMs para poder fazer as operações de cópia / execução, pois parece que você só tinha uma máquina centralizada que fazia isso antes.
Isso também reduzirá sua latência, já que você não estará usando uma máquina RDP antes de executar as operações.
No geral, a menos que eu não tenha entendido alguma coisa em sua configuração atual, isso seria uma medida recomendada para a escalabilidade de sua rede virtual.