Bem, vejo que você digitou "-convert-to pdf" em vez de "--convert-to-pdf". Talvez você tenha feito um erro semelhante no seu script php? É difícil dizer sem ver o código PHP.
Por favor, forneça detalhes: como você chama o libreoffice do PHP, o que os logs de erro dizem, etc.
Finalmente, se você estiver executando o SElinux e não o Ubuntu, por favor leve a questão para um fórum do SELinux.