Eu sei que essa é uma pergunta bastante antiga, mas acabamos de analisar essa questão e passar algumas horas tentando descobrir a solução. Para outras pessoas que podem encontrar esse problema no futuro, resolvemos isso atualizando uma chave de registro
HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\Session Manager\Kernel\MitigationOptions) from enabled (1000000000000) to disabled (2000000000000).
Fonte: link
Conforme descrito no link acima, estávamos com esse problema apenas com IE11
em Win10
. Edge
estava funcionando bem. Depois de atualizar o valor do registro, os ícones também foram exibidos no IE.