Eu sincronizo somente marcadores e senhas. Eu não sincronizo preferências. Quando entro em sincronia com um novo perfil do Firefox, ele seleciona automaticamente os Favoritos e as senhas nas configurações de sincronização.
Como você provavelmente não altera seu conjunto de complementos com freqüência, eu criaria uma pasta de favoritos com os complementos favoritos em vez de instalá-los automaticamente. Em seguida, depois de fazer login no Sync, seus favoritos serão sincronizados e, em seguida, você poderá usar os Add-ons marcados para instalar manualmente os complementos desejados para essa máquina específica.