As instruções / pacotes no site do MongoDB estão atualmente disponíveis apenas para o LTS Ubuntu 12.04 e 14.04. Os pacotes são configurados para usar o upstart ao invés do systemd. Você precisa criar um arquivo systemctl para estar pronto para o systemd. Crie-o por
sudo nano /etc/systemd/system/mongodb.service
Será parecido com
[Unit]
Description=High-performance, schema-free document-oriented database
After=network.target
[Service]
User=mongodb
ExecStart=/usr/bin/mongod --quiet --config /etc/mongod.conf
[Install]
WantedBy=multi-user.target
Agora você pode iniciar o serviço e verificar seu estado por
sudo systemctl start mongodb
sudo systemctl status mongodb
e, finalmente, ativá-lo permanentemente por
sudo systemctl enable mongodb
(Fonte: Como instalar o MongoDB no Ubuntu 16.04 )